BioMed Central Databases

Catalogue de bases de données, la plupart en accès libre, comprenant à ce jour plus de 1100 bases biomédicales.

Producteur : BioMed Central

Intute, répertoire sélectif de ressources pour l'enseignement et la recherche

Sélection de sites validée par des experts scientifiques universitaires, recouvrant 4 grands domaines :

- Science and Technology : sciences physiques, ingénierie, informatique, mathématiques, géographie et environnement
- Arts and Humanities : arts et industrie artistique, loisirs et sport, sciences humaines
- Social Sciences : sciences sociales, économie et droit
- Health and Life Sciences : médecine et sciences de la vie

Intute offre également des ressources telles que les sites clés d'un domaine, des méthodes pour rechercher d'autres sites du domaine, etc. Chaque site recensé est accompagné d'une notice descriptive.

Producteur : Consortium regroupant 7 universités du Royaume-Uni et leurs partenaires

OmniMedicalSearch, méta-moteur de recherche spécialisé dans le domaine médical et biologique

OmniMedicalSearch propose les résultats de requêtes obtenus à partir de l'interrogation simultanée de plusieurs moteurs de recherche, sites web et bases de données.Ce méta-moteur permet d'interroger le web, mais également d'effectuer une recherche de news, d'images et d'acronymes.

Pour la recherche web, vous avez le choix entre 3 groupes d'outils :

- All Search Engines : option de recherche par défaut à partir de 15 moteurs, sites et BD.
- MedPro Search : recherche à partir de 7 sources : PubMed, National Library of Medicine, ClinicalTrials.gov, HealthFinder.gov, Cancer.gov, Centers for Disease Control et Teoma (restreint aux sites .edu)
- Basic Search : 8 sources : MedHelp.org, MedWebPlus.com, eMedicine.com, WebMD.com, MedlinePlus, Mediwarp.com, Healthopedia.com, et Yahoo (restreint aux sites .org)

Il est également possible de sélectionner un seul outil de recherche parmi les 15 proposés dans la liste déroulante.
Les résultats sont présentés avec une liste de mots reliés aux termes de la recherche et utilisables pour affiner, préciser la recherche.

La recherche d'images se fait par l'interrogation simultanée de 6 sources :
- AltaVista Image, Bristol Biomedical Image Archive, History of Medicine, MedPix, PicSearch et Public Health Image Library La recherche peut là aussi être réalisée sur une seule de ces BD.

Producteur : SofterLogic, Royaume-Uni

Scirus, moteur de recherche spécialisé dans les domaines scientifiques

Scirus indexe plus de 167 millions de pages de niveaux universitaire et recherche dans les domaines scientifique, médical et technique.
Les documents indexés sont de type rapports, articles, périodiques.
Les sites universitaires et scientifiques sont également localisés.

Les ressources proviennent des bases de données suivantes :

- MEDLINE citations - ScienceDirect full-text articles
- patents from the USPTO
- e-prints on ArXiv.org
- BioMed Central full-text articles
- NASA technical reports
- e-prints on e-prints on CogPrints
- preprints from the Mathematics Preprint Server
- preprints from the Computer Science Preprint Server

La recherche avancée permet de limiter la requête sur la date, le type de document, le format de fichier, la source ou la thématique en combinaison avec les opérateurs booléens classiques.

Producteur : Elsevier Science

Google Scholar, moteur de recherche spécialisé dans les domaines scientifiques

Google lance une nouvelle extension de son moteur de recherche : Google Scholar, destinée aux chercheurs et aux étudiants. Pour l’instant Google Scholar n’est qu’en version bêta et en anglais, mais la base contient des sources françaises, ainsi que des références en italien, allemand, espagnol et portugais.
Les domaines couverts sont la biologie, la médecine, la physique, l’informatique, et les sciences économiques.

Google Scholar permet de trouver des articles à partir d’une grande variété de publications d’universités, de laboratoires, d’académies, d’éditeurs scolaires disponibles sur le web :

- thèses, articles, rapports, revues, bibliographies, etc.

On trouve notamment, pour chaque article cité, les références des articles qui le citent (cited by...).
Un article référencé sur plusieurs sites n'apparait qu'une fois, les liens vers les autres sites sont donnés à la fin de la description.
Points faibles :

- Google ne donne aucune information sur la taille de la base de données ni sur la périodicité de sa mise à jour

- il n'y a pas de limitation possible par date de publication

Producteur : Google

BASE, moteur de recherche scientifique multi-disciplinaire

BASE (Bielefeld Academic Search Engine) indexe plus de 900 archives depuis fin octobre 2007.
Développé et maintenu par la bibliothèque de l'université de Bielefeld en Allemagne, le moteur utilise, parallèlement à la recherche en texte intégral, le thésaurus Eurovoc. Ce dernier compte à ce jour 239 000 termes pour l'ensemble des 21 langues des ressources prises en compte.
Liste complète des sources indexées dans BASE : ici

Producteur : Bielefeld University Library

BioText Search Engine, moteur de recherche spécialisé en biologie

Ce moteur permet d’accéder à la littérature scientifique biomédicale par le biais des légendes des figures, tableaux et illustrations d’articles. Tous les articles en libre accès de PubMed Central sont indexés, soit plus de 300 journaux, 40 000 articles, 100 000 figures et 60 000 tableaux.
La recherche se fait sur les champs Abstracts, Figure Captions ou Tables.
Des exemples sont disponibles sur le site de BioText Search Engine.

Producteur : University of California, Berkeley

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Le Système Universitaire de DOCumentation (SUDOC)

Le catalogue du Sudoc permet d'effectuer des recherches bibliographiques sur les collections des bibliothèques universitaires françaises et autres établissements d'enseignement supérieur, pour tous les types de documents et sur les collections de périodiques de 2900 centres documentaires. Il permet également de savoir quelles bibliothèques détiennent ces documents.

Pour rechercher uniquement les thèses :
     - choisir "Sudoc - Catalogue"
     - sélectionner "Options"
     - Type de publication : sélectionner "Thèses", puis "Appliquer"

Dans les critères de recherche, une zone "Note de thèse" permet de faire des recherches par
     - type de doctorat
     - discipline
     - établissement
     - année

Producteur : ABES, Agence Bibliographique de l'Enseignement Supérieur

THESA

THESA signale les sujets de thèses en cours dès la première année d'inscription en thèse du candidat au doctorat jusqu'à la soutenance de la thèse. Le signalement de la thèse est conservé dans la base un an après la délivrance du diplôme ; la référence bibliographique complète de la thèse figurera alors dans la base de données bibliographiques du SUDOC, qui signale les thèses soutenues en France dans les Universités et les Grandes Ecoles habilitées.

Producteurs : INIST et Conférence des Grandes Écoles

Thèses en neuroscience

Ce service fournit une liste des thèses en neuroscience, avec nom de l'auteur, titre, résumé et liste des publications originales relatives à la thèse. Cette page est hébergée par le serveur web de la Société des Neurosciences.

Le site répertorie toutes les thèses en neuroscience effectuées dans les laboratoires des membres de la Société des Neurosciences, quelque soit la Formation doctorale, l'École Doctorale ou l'Institution dans le cadre desquelles s'est déroulée la thèse. Ce répertoire contient actuellement plus de 400 thèses.

Il permet :
  - l'auto-archivage par l'auteur de la thèse (titre, résumé et liste de publications) grace à un formulaire d'insertion.
  - la consultation/recherche de thèses sur les champs "nom, année, ville, université, formation, laboratoire et mots-clés".

Producteurs : Société des Neurosciences

thèses-EN-ligne

Ce serveur a pour objectif de permettre l'archive et l'autoarchivage de thèses de doctorat et d'habilitation ainsi que de documents relatifs à la soutenance (transparents, enregistrement audio ou vidéo). Le site du CCSD thèses-EN-ligne a pour objectif de promouvoir l'auto-archivage en ligne des thèses, documents importants pour la communication scientifique entre chercheurs.
Ce site est géré par le CCSD en collaboration avec la Cellule MathDoc.

Producteur : CCSD,Centre pour la Communication Scientifique Directe.C'est une Unité Propre de Service (UPS 2275) du CNRS, hébergée par le Centre de Calcul de l'IN2P3 à Villeurbanne.

BiblioVie : Rechercher une monographie

BiblioVie est le portail d'information scientifique des unités CNRS en Sciences de la Vie.
Le service "Rechercher une monographie" donne actuellement accès gratuitement par Internet à des actes de congrès, rapports, thèses ou ouvrages en Biologie et Médecine.
Le catalogue peut être interrogé par domaines scientifiques, par organismes ou lieux de congrès.
Ce service permet également de proposer le recensement de ses propres documents disponibles en ligne.

Producteur : INIST

Cyberthèses

Projet international de mise en ligne gratuite et complète des thèses sur Internet.
Cyberthèses est un programme d'archivage et de diffusion électronique de thèses. Il est issu d'un projet de coopération entre les Presses de l'Université de Montréal et l'Université Lumière, Lyon II, soutenu par le Fonds Francophone des Inforoutes, et ayant pour objet l'édition et la diffusion électronique de thèses sur le Web.
4 sites permettent d'accéder aux thèses en texte intégral, dont le Portail Francophone des Thèses Electroniques (plus de 50 000 thèses).

Producteurs : Université Lumière Lyon II et Presses de l'Université de Montréal

PASTEL

PASTEL est un site élaboré par les Centres de Documentation des 10 grandes écoles d'ingénieurs, regroupées sous le label de ParisTech, qui a pour mission de mettre en ligne les thèses des élèves des grandes écoles d'ingénieurs de Paris (plus de 1500 thèses depuis 1997).
Domaines couverts : sciences exactes essentiellement, dont les sciences de la vie.

Producteur : ParisTech

Thèses en ligne à l'INRA

Ce site donne accès aux "Thèses disponibles en texte intégral" dont les recherches ont été effectuées dans l'une des Unités de recherche de l'INRA (ou dans une Unité Mixte de Recherche). Les thèses (une cinquantaine) sont extraites de la base de données bibliographiques ProdINRA recensant les publications des Unités de l'INRA. La base ProdINRA comprend à ce jour environ 8000 thèses (accroissement de 300 par an).
Thématiques : Reproduction animale, Pathologie animale, Science du sol, Physiologie végétale, Science de l'environnement, Biochimie, Génétique animale, Science de la terre, Ecosystèmes forestiers.

Producteur : INRA

Archimer : Archive institutionnelle de l'IFREMER

Le Service de la Documentation et des Bibliothèques de l'Ifremer, institut français de recherche pour l'exploitation durable de la mer, offre l'accès au texte intégral des thèses de doctorants accueillis dans les unités Ifremer ainsi qu'une sélection de rapports, actes de congrès, articles publiés.
Ce site ouvert en août 2005 propose à ce jour plus d'une centaine de thèses.

Producteur : IFREMER

Projet CITHER

Doc'INSA offre le texte intégral de la majorité des nouvelles thèses de l'INSA de Lyon en format PDF, au sein du projet CITHER (Consultation en texte Intégral des THèses En Réseau).

Producteur : Doc'INSA, INSA - Lyon

Thèses en ligne de l'Université Bordeaux I

L'Université Bordeaux 1 a entrepris la diffusion en texte intégral des thèses soutenues au sein des quatre Ecoles doctorales (ED) qu'elle compte : ED Sciences du Vivant, Géosciences, Sciences de l'Environnement, ED Sciences Chimiques, ED Sciences Physiques et de l'Ingénieur, ED Mathématiques et Informatique.

Producteur : Université Bordeaux 1

Annuaire Yahoo-France

Yahoo-France propose une rubrique "Enseignement et formation > Enseignement supérieur > Thèses et mémoires" dans le but de recenser toutes les thèses francophones en ligne.

Producteur : Yahoo France

La NDLTD

La "Networked Digital Library of Thesis and Dissertations" est un projet qui regroupe au niveau mondial les institutions ayant un programme de diffusion électronique (texte intégral) de leurs thèses.
Cette fédération rassemble, à ce jour, une centaine d'universités et consortia à travers le monde. Liste des membres : http://www.ndltd.org/about/members/ndltd-members.
Accès libre à l'interface d'interrogation puis de consultation des mémoires et thèses : http://rogers.vtls.com:6080/visualizer/ou http://www.ndltd.org/serviceproviders/scirus-etd-search

UMI Dissertation Abstracts

La base de données internationale "Dissertation abstracts" est également connue sous le nom de son interface : "ProQuest Digital Dissertations". Elle propose principalement des thèses canadiennes et américaines, mais également des thèses européennes.
L'accès public en Open Access est limité aux deux dernières années : PQDT Open (ProQuest Dissertations & Theses).

Le service d'information scientifique et technique de l'INRA propose une sélection de bases de données françaises et étrangères contenant des thèses sous forme de références bibliographiques ou en texte intégral : http://www.inra.fr/theses/sources-these.html

On trouve également dans les Signets de la BnF (Bibliothèque nationale de France) une très intéressante page consacrée aux thèses, signalant entre autre des répertoires de thèses étrangères : http://signets.bnf.fr/html/categories/c_011theses.html

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TFLi : Le Trésor de la Langue Française informatisé

Le TLFi est la version informatisée et enrichie du Trésor de la Langue Française, TLF, dictionnaire de la langue française des XIXe et XXe siècles en 16 volumes. Le TLF est le fruit de recherches linguistiques approfondies sur l’histoire et l’usage actuel du vocabulaire français.

Le TLFi propose :

- 100 000 mots avec leur histoire, 270 000 définitions, 430 000 exemples, 350 millions de caractères

- une assistance aux mots croisés

- un traitement exhaustif des mots du XIXe siècle et XXe siècle

- de nombreux exemples littéraires pour chaque entrée

- l'intégration des derniers apports de la recherche linguistique

Le TLFi permet également par hypernavigation :

- de consulter la définition d'un mot dans le TLFi lui-même ou dans les dictionnaires de l'académie

- de rechercher les occurrences du texte dans FRANTEXT

- de consulter la base de connaissance lexicale de l'ATILF

- de consulter la Base Historique du Vocabulaire Français (BHVF)

Producteur : CNRS, UMR Analyse et Traitement Informatique de la Langue Française (ATILF), Université Nancy 2

Orthonet

Banque de données orthographiques et grammaticales de la langue française.
Orthonet a été développé pour répondre à toutes les questions sur la langue française, faciliter son emploi, résoudre les difficultés que rencontrent les usagers, francophones ou non, surtout dans l’écrit, les faire bénéficier d’une documentation sans cesse améliorée.

Attention, Orthonet n'est pas un dictionnaire, mais bien un correcteur orthographique. Pour cela, il propose :

- plus de 25 000 réponses sur des difficultés d'orthographe ou de syntaxe
- une conjugaison modèle
- plus de 1000 conjugaisons difficiles
- l'orthographe des noms de nombres
- les principaux formants (grecs) de vocabulaire savant
- des éléments de grammaire sur l'accord des participes
- idem sur les formes d'infinitif
- des conseils sur les choix singulier/pluriel des noms
- des conseils sur l'orthographe nouvelle

Producteur : Conseil International de la Langue Française (CILF)

Dictionnaire Électronique des Synonymes : CRISCO

Le laboratoire CRISCO (Centre de Recherche Inter-langues sur la Signification en COntexte), unité mixte de recherche de l'Université de Caen et du CNRS mène des recherches en linguistique informatique qui ont conduit les chercheurs à construire un dictionnaire des synonymes du français sous forme d'une base de données exploitable par des programmes informatiques.
Le dictionnaire des synonymes du CRISCO contient 49 000 entrées, chacune suivie de ses synonymes. Les relations de synonymie proviennent de sept dictionnaires classiques: deux dictionnaires analogiques (le Grand Larousse et le Grand Robert), deux dictionnaires des synonymes du 19e siècle (Lafaye et Guizot), et trois dictionnaires des synonymes du milieu et de la fin du 20e siècle (Bailly, Bénac et Du Chazaud).
La consultation du dictionnaire exploite les possibilités offertes par Internet, notamment l'hypernavigation qui permet aux utilisateurs de trouver rapidement le terme manquant. Une requête reçoit en réponse une liste des synonymes et un classement fondé sur le nombre de connexions que ces synonymes forment entre eux. Il suffit de cliquer sur un terme de la liste pour obtenir ses synonymes, puisque chaque terme est lui-même un lien vers sa propre liste de synonymes.
Il est possible de visualiser des espaces sémantiques (graphes des relations synonymiques).

Producteur : Laboratoire CRISCO, FRE 2805 CNRS - Université de Caen Basse-Normandie

Le Grand Dictionnaire Terminologique

Le grand dictionnaire terminologique de l'Office québécois de la langue française est une banque de données terminologique. C'est un dictionnaire bilingue très utile en tant que traducteur de termes (attention : ce n'est pas un outil de traduction automatique de phrases). Il donne accès à près de 3 millions de termes français et anglais du vocabulaire industriel, scientifique et commercial, dans 200 domaines d'activité.
La liste de termes résultant d'une interrogation apparaît dans une zone Index. Les termes sont présentés par ordre alphabétique. Sous chaque terme figure un ou plusieurs domaines suivis, entre parenthèses, du nombre de fiches pour ces domaines. En cliquant sur un domaine, la fiche terminologique correspondante apparaît à droite. Un terme peut être indexé à plus d'un domaine.
Si la recherche est lancée "dans la définition", le résultat affiché est composé de la liste des termes. Par exemple, de l'interrogation des mots-clés "fruit jaune" résulte l'affichage de nombreux termes, tels que "orange", "banane", "cabosse", etc., dans la zone Index.

Producteur : Office québécois de la langue française

Les Atlas sémantiques : Dictionnaires des synonymes français et des synonymes anglais - Traducteurs anglais/français et français/anglais

Ces outils ont été développés par une équipe de l'Institut des Sciences Cognitives UMR 5015.
Deux dictionnaires bilingues (français-anglais et anglais-français) et deux dictionnaires de synonymes (français et anglais) sont accessibles en ligne.
Le lexique français contient environ 52000 entrées. Le logiciel propose, pour chaque mot, des synonymes et liens analogiques. C’est également un modèle pour la représentation géométrique des valeurs sémantiques des différents termes.

Producteur : ISC, Institut des Sciences Cognitives UMR 5015 CNRS-Université Lyon 1

Biology Image Library

Encyclopédie d'images online en biologie et médecine
Biology Image Library est une collection en ligne d'images, vidéos, illustrations et animations utilisables en recherche et enseignement.
Couverture thématique :
     • Biologie du développement
     • Histologie et histopathologie
     • Immunologie
     • Microbiologie et parasitologie
     • Biologie cellulaire et moléculaire
     • Neuroscience
     • Biologie végétale

Producteur : BioMed Central

Wikipédia

Wikipédia est un projet "d'encyclopédie libre, gratuite, écrite coopérativement" comme l'écrit A. Caraco dans l'article publié dans le BBF (cf référence ci-dessous). Un wiki est un site web dynamique permettant la publication collaborative de contenus et où toute personne peut être auteur.
Le but de Wikipédia est de créer une source d'informations dans le format d'une encyclopédie référencée qui soit accessible à tous gratuitement.
Les textes de Wikipédia sont couverts par la licence de documentation libre GNU.
La validation des articles est collective et leur qualité dépend des contributeurs. La liste des contributeurs ainsi que leur biographie est consultable sur le site.
Wikipédia existe dans plus de cinquante langues, avec des liens hypertextes entre les articles d'une même langue et également de différentes langues.
Le projet se développe de façon exponentielle ; en 2004, près de 45 000 articles existent en français et 300 000 en anglais (site anglais : http://en.wikipedia.org/wiki/Main_Page).

Lisez l'article d'Alain Caraco sur Wikipédia, disponible en ligne : Wikipédia. Une encyclopédie libre, gratuite et écrite coopérativement. (2004) BBF 49(6): 80-85

Tout pour les sciences exactes : constantes, nomenclatures, biographies, histoire ....

Sélection de ressources en ligne concernant entre autres les constantes et nomenclatures dans les domaines des Sciences de la Vie, de la Chimie ou des Mathématiques, ainsi que différents dictionnaires (scientifique, médical, synonymes, biologie moléculaire et biochimie, etc.).
Producteur : Jean-Pierre Lardy, URFIST de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1

DADI, répertoire des bases de Données grAtuites Disponibles sur Internet

Dadi est un répertoire de bases de données en consultation gratuite. Les bases de données sont indexées selon la Classification Décimale Dewey. À ce jour, le site propose 896 bases de données dans 100 catégories (241 en Sciences de la nature et Mathématiques).
Producteur : Jean-Pierre Lardy, URFIST de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1

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